穴盘苗基质中的水是通过蒸发和根对水的吸收而损失的，前者在子叶展开前起主要作用；而在子叶展开之后，受到蒸腾作用所---的根对水的吸收起到主要作用。当然托起穴盘估计它的重量，以此判断基质的湿度是一种较为理想的测试方法。反之，基质中水分过于饱和也不行，会造成根系缺氧（0-2%）穴盘苗生产水分管理一般以子叶展开为分界线。在子叶展开之前的水分管理比较简便，即要穴孔基质的下半部一直保持湿润。仅仅控制穴孔上半部分基质的干湿交替即可。
穴盘苗好的基质应该具备以下几项特性：理想的水分容量；---的排水能力和空气容量；容易再湿润；---的孔隙度和均匀的空隙分布；稳定的维管束结构，矮牵牛穴盘苗，少粉尘；恰当的ph值，5.5-6.5；含有适当的养分，能够---子叶展开前的养分需求；而夏季或初秋，就要改为银灰色的穴盘，以反射较多的光线，欧石竹穴盘苗，避免根部温度过高。。基质至少要有5mm的---才会有重力作用，使基质中的水分渗下，空气进入穴孔越深，含氧量就越多。穴孔形状以四方倒梯形为宜，穴盘苗，这样有利于引导根系向下伸展，而不是象圆形或侧面垂直的穴孔中那样根系在内壁缠绕。较深的穴孔为基质的排水和透气提供了更有利的条件。
穴盘苗对土壤中的湿度、养分、氧气、ph值、ec值的变化就越敏感。而穴孔越深，基质中的空气就越多，就有利于透气、淋洗盐分以及透气，有利于根系的生长。草花选择适当的穴盘，选择好的基质，并正确地填充基质，打孔，将种子均匀播入穴孔的中央，给种子均匀覆盖，适当浇水。这就完成了工厂化穴盘育苗的一步工作。二、肥料和养分育苗肥的选择：一般来说，好的商品育苗基质能够提供子叶完全展开之前所需的所有养分。
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